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新的生物信息学工具可识别肿瘤细胞的染色体改变

2024-04-10 14:48:32 生活
导读 巴塞罗那大学 (UB) 和巴塞罗那生物医学研究所 (IRB 巴塞罗那) 的一个团队设计了一种新的生物信息学工具来识别癌细胞特征的染色体改变...

巴塞罗那大学 (UB) 和巴塞罗那生物医学研究所 (IRB 巴塞罗那) 的一个团队设计了一种新的生物信息学工具来识别癌细胞特征的染色体改变。这种新的检测系统被称为 QATS(生物图像中环形核的 QuAntification),是一种计算生物成像处理工具,通过其自动识别和量化与肿瘤中染色体不稳定性相关的表型的能力,将有助于改善肿瘤研究和分类。癌细胞的细胞核。

该研究发表在《生物信息学》杂志上,由布法罗大学医学与健康科学学院和 IDIBAPS 的 Caroline Mauvezin 教授以及巴塞罗那 IRB 成员研究员 Carles Pons 签署。

识别癌细胞的染色体变化

染色体不稳定在实体瘤中很常见,它与癌症的开始和进展以及癌细胞的转移有关。这种现象是由细胞分裂过程中染色体数量和结构的变化引起的,可以引起 DNA 的变化并影响整个细胞机制。此外,染色体不稳定性不仅有利于肿瘤的起源和进展,而且还增强了肿瘤内的异质性和抗肿瘤治疗的耐药性。

癌细胞可以在高度染色体不稳定性的情况下存活。新的 QATS 工具是一个预测系统,将有助于识别和量化生物图像中的环形核(染色体不稳定的新生物标志物)。

“环形核在表型上与正常细胞核不同,因为它们呈现环形形状和带有胞质物质的空隙。在研究领域,这些最近被定性为染色体不稳定的重要生物标志物,它们代表了理解和对抗癌症的创新途径”,布法罗大学生物医学系的 Caroline Mauvezin 教授指出。 “传统上,癌细胞的染色体不稳定性水平只能通过量化微核来评估,微核是源自细胞核的不规则结构,可能含有染色体或染色体片段”,她补充道。

巴塞罗那 IRB 结构生物信息学和网络生物学实验室成员 Carles Pons 表示:“因此,将评估环形核的策略整合到研究和临床实践中,对于肿瘤分层和患者特异性治疗的设计具有巨大的潜力。”

目前,QATS 系统已在癌细胞系的临床前研究中显示出其在识别和量化环形核方面的效率。作者总结道:“未来,QATS 在更复杂的生物场景(来自患者活检的人体组织样本)中的应用将代表科学界和医学界在改善癌症诊断和患者治疗方面的突破。”

标 签

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